| 吴璟莉,陈建二,王建新.一种基于最少片段删除模型重建单体型的粒子群优化算法[J].高技术通讯(中文),2009,19(2):194~199 |
| 一种基于最少片段删除模型重建单体型的粒子群优化算法 |
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| DOI： |
| 中文关键词: 单核苷酸多态性，单体型，最少片段删除，粒子群优化，编码 |
| 英文关键词: |
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| 作者 | 单位 | | 吴璟莉 | 中南大学信息科学与工程学院；广西师范大学计算机科学与信息工程学院 | | 陈建二 | 中南大学信息科学与工程学院 | | 王建新 | 中南大学信息科学与工程学院 |
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| 中文摘要: |
| 利用最少片段删除(MFR)模型研究了个体单体型重建的算法。利用单核苷酸多态性(SNP)位点杂合率低的特性，引入了一种短粒子编码方式，提出了一种重建单体型的粒子群优化算法P MFR。利用国际人类基因组单体型图计划发布的CEPH样本(祖籍是北欧或西欧的美国犹他州人)中60个个体在1号染色体上的单体型进行实验分析，实验结果显示，与以往求解MFR模型的算法相比较，P MFR算法能够获得更高重建率的单体型。此外，由于采用了较短的粒子位置编码方式，P MFR算法在重建长单体型时仍具有较高的执行效率，有很好的实用价值。 |
| 英文摘要: |
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