| 赵喜全,李旭,吕慧伟,谭光明.KSI: 面向TB级别的DNA序列匹配软件库[J].高技术通讯(中文),2015,25(12):997~1004 |
| KSI: 面向TB级别的DNA序列匹配软件库 |
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| 中文关键词: 生物信息学， k mer匹配， DNA序列处理， 应用程序编程接口 |
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| 中文摘要: |
| 为了满足对不同物种进行DNA序列分析的需求和适应DNA序列数据的快速增长，针对目前DNA序列分析软件大都各自实现一套序列存储和查询功能，工作重复且没有考虑并行性、扩展性和分布式系统或环境的缺陷，基于DNA序列分析的基本操作k mer匹配，设计并实现了一个面向TB量级的DNA序列匹配软件库——k mer查找接口（KSI）。KSI提供了一套分布式环境下的编程接口，并且针对生物计算领域的DNA序列匹配进行优化。实验显示，KSI为DNA序列匹配提供了一个高效的解决方案。 |
| 英文摘要: |
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